Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms