Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms