Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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