Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC174Q6PII3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms