Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT80Q6KB66 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms