Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD7BQ6GQQ9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms