Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ANKRD40Q6AI12 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms