Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms