Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms