Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SAMD13Q5VXD3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SAMD13Q5VXD3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SAMD13Q5VXD3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SAMD13Q5VXD3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD13Q5VXD3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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