Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms