Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms