Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms