Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOGA3Q5TF21 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOGA3Q5TF21 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms