Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C10orf55Q5SWW7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms