Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms