Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms