Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A8Q2Y0W8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A8Q2Y0W8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms