Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGSM1Q2NKQ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGSM1Q2NKQ1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms