Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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