Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KNOP1Q1ED39 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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