Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms