Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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