Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DDR2Q16832 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms