Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms