Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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