Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SGCAQ16586 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SGCAQ16586 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SGCAQ16586 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCAQ16586 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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