Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A3Q16572 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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