Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms