Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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