Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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