Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB3Q15768 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms