Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms