Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms