Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCOLCEQ15113 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms