Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME4Q14997 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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