Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPNMBQ14956 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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