Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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