Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms