Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SPIDRQ14159 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SPIDRQ14159 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SPIDRQ14159 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SPIDRQ14159 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPIDRQ14159 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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