Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXOSC2Q13868 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXOSC2Q13868 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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