Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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