Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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