Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TARBP1Q13395 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TARBP1Q13395 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms