Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SP140Q13342 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SP140Q13342 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SP140Q13342 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SP140Q13342 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP140Q13342 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SP140Q13342 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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SP140Q13342 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SP140Q13342 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP140Q13342 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP140Q13342 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP140Q13342 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SP140Q13342 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SP140Q13342 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SP140Q13342 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SP140Q13342 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP140Q13342 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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