Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME3Q13232 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NME3Q13232 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NME3Q13232 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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NME3Q13232 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NME3Q13232 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NME3Q13232 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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