Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
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