Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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GRIK3Q13003 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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GRIK3Q13003 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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GRIK3Q13003 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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