Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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