Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GRIN2AQ12879 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
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